1991 yılında Tercüman Gazetesi'nden Milliyet Gazetesi'ne transfer olan Ali Eyüboğlu muhabirlik, şef yardımcılığı, Magazin Müdürlüğü,Milliyet Televizyon ekinin yayın yönetmenliği görevlerinde bulundu.

Yeni görevine 1 Ocak 2015'ten itibaren başlayacak olan Ali Eyüboğlu, aynı zamanda ana gazetedeki köşe yazılarını yazmaya ve Milliyet'in cumartesi günleri yayınlanan TV ekini yapmaya devam edecek.